由Sage Bionetworks开发的Synapse.org集成允许研究人员在整个Synapse平台上发现生物医学数据、查看项目结构,并为获得授权的用户检索其数据资产的信息。本文介绍如何设置和使用Claude的Synapse.org集成,以推进您的研究和分析工作流程。
Synapse.org集成依赖于Claude使用远程连接器(在新标签页中打开)的能力。
此集成提供的内容
服务包括搜索和(元)数据检索服务。数据访问将受每个项目定义的访问控制约束。部分数据公开可用,而其他数据则需要Synapse治理团队在访问前进行批准。
谁可以访问Synapse.org集成
- 拥有注册Synapse账户的个人(免费注册(在新标签页中打开))
- 数据访问可能受到贡献者的使用限制约束
有关访问此集成的更多详情,请参阅Synapse的MCP服务器文档(在新标签页中打开)。
设置Synapse.org集成
适用于组织所有者(团队版和企业版)
- 导航至“管理设置”>“连接器”
- 点击“浏览连接器”
- 点击“Synapse.org”
- 点击“添加到您的团队”
适用于个人Claude用户
- 导航至“设置”>“连接器”
- 点击“连接”
- 按照说明使用您的Synapse.org账户进行身份验证
了解如何在Claude中查找并连接工具(在新标签页中打开)。
适用于Claude Code用户
- 按照上述步骤在Claude中连接Synapse.org
- 使用同一Claude账户登录Claude Code(运行
/login可切换账户),然后重新启动Claude Code - 运行
/mcp并检查该连接器是否出现在列表的claude.ai部分中(如果未显示,请在该部分末尾选择显示未使用的连接器)
了解如何在Claude Code中使用Claude的连接器(在新标签页中打开)。
有关Synapse.org集成的技术详情,请参阅Synapse的MCP服务器文档(在新标签页中打开)。
常见使用场景
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在整个Synapse.org平台上搜索可重复使用的科学数据
在Synapse中查找与阿尔茨海默病相关的RNA测序数据集
在Synapse中搜索单细胞转录组学数据集
在NF数据门户中查找丛状神经纤维瘤的基因组测序数据
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获得授权的用户可以查看项目内文件夹、文件、表格、数据集的层级结构,以帮助组织和监控数据资产
解释一下公开的AACR Project GENIE项目中的文件和文件夹
请给我简要概述一下SEA-AD挑战项目中agentic track(syn66496696)的数据资产?
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获取Synapse中实体的自定义元数据
文件syn4553239的注释和元数据是什么?
请向我展示数据集syn66364675的自定义元数据字段
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获取Synapse中实体的溯源信息,以帮助理解过去的数据处理过程
文件syn51543273的处理历史是什么?
请向我展示数据集syn68719289的数据血缘关系和上游依赖关系