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在 Claude 中使用 PubMed 连接器

设置并使用 Claude 的 PubMed 集成，以访问数百万篇生物医学研究文章和临床研究。

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PubMed 集成可访问数百万篇生物医学研究文章和临床研究，使 Claude 能够访问摘要和完整论文，以阐明实验方法、识别关键发现、确定新颖性和适用性，并呈现特定论文以供深入探索。本文介绍了如何设置和使用 Claude 的 PubMed 集成来加速您的研究工作流程。

PubMed 集成依赖于 Claude 使用远程连接器的能力。

此集成提供什么

PubMed 集成将 Claude 直接连接到美国国家医学图书馆维护的 PubMed 数据库。PubMed 拥有超过 3600 万条生物医学文献引用，是医学研究、科学研究和健康信息的首要资源。

此集成使您能够：

  • 使用关键词、作者、期刊或高级查询语法搜索研究文章
  • 获取完整的文章元数据，包括摘要、作者、出版日期、引用以及完整文章的链接
  • 在可用时访问 PubMed Central (PMC) 的全文文章
  • 在 NCBI 数据库中查找相关文章
  • 将引用与 PubMed ID 进行匹配以进行验证和引用
  • 在 ID 格式（PMID、PMC ID、DOI）之间进行转换

设置 PubMed 集成

对于组织所有者（团队版和企业版）

  1. 导航到管理员设置 > 连接器
  2. 点击"浏览连接器"
  3. 点击"PubMed"
  4. 点击"添加到您的团队"

对于个人 Claude 用户

  1. 导航到设置 > 连接器
  2. 找到"PubMed"
  3. 点击"连接"

了解有关在 Claude 中查找和连接工具的更多信息。

对于 Claude Code 用户

  1. 按照上述步骤在 Claude 中连接 PubMed
  2. 使用相同的 Claude 账户登录 Claude Code（运行 /login 以切换账户），然后重启 Claude Code
  3. 运行 /mcp 并检查该连接器是否出现在列表的 claude.ai 部分中（如果未显示，请在该部分末尾选择显示未使用的连接器）

了解有关在 Claude Code 中使用来自 Claude 的连接器的更多信息。

通过 Messages API 使用 PubMed MCP

开发者可以使用 MCP 连接器，直接通过 Claude 的 Messages API 连接到 PubMed 集成。这使您能够构建以编程方式利用 PubMed 搜索功能的应用程序。

要求

一个 Anthropic API 密钥

Beta 标头：anthropic-beta: mcp-client-2025-11-20

设置

示例请求

python
import anthropic

client = anthropic.Anthropic()

response = client.beta.messages.create(
    model="claude-sonnet-5-5",
    max_tokens=4096,
    messages=[{"role": "user", "content": "Find recent papers on CRISPR gene editing in cancer treatment"}],
    mcp_servers=[{"type": "url", "url": "https://pubmed.mcp.claude.com/mcp", "name": "pubmed"}],
    tools=[{"type": "mcp_toolset", "mcp_server_name": "pubmed"}],
    betas=["mcp-client-2025-11-20"]
)

常见使用场景

搜索研究文章

让 Claude 查找您感兴趣的生物医学或科学主题的文章。示例提示：

查找关于黑色素瘤免疫疗法的最新研究

向我展示上个月关于 CRISPR 基因编辑的研究

查找与我正在研究的提案或基因相关的文献

获取文章详情和元数据

检索有关特定文章的全面信息。示例提示：

关于这个主题被引用最多的论文有哪些？

查找关于此主题的最新论文并总结该领域的新贡献？

这项研究的作者是谁？

那篇论文是什么时候发表的？

访问全文文章

对于在 PubMed Central 中可用的文章，检索完整文章文本以帮助您的研究。示例提示：

比较这两篇论文的方法

这些论文之间有哪些共同的结论，它们在哪些方面存在分歧？

阅读这些论文，帮我找出对我的假设最重要的结论

查找相关文章

在 NCBI 数据库中发现类似研究。示例提示：

查找与此类似的研究

将本研究的发现与该领域的其他研究进行比较

将引用与 PubMed ID 匹配

验证引用并从期刊参考文献中查找 PubMed ID。示例提示：

查找这条引用：Smith J, Nature 2020, vol 52, page 811

从我的参考文献列表中找到此参考文献对应的 PubMed 条目

我有一篇论文的引用，您能在 PubMed 中找到它吗？

我想讨论一下与这个 PMID 相关联的论文

常见问题

PubMed 集成是免费使用的吗？

是的！该集成对所有 Claude 用户免费。PubMed 是美国国家医学图书馆提供的免费公共资源。

我可以访问任何论文的全文文章吗？

只有当文章存在于 PubMed Central (PMC) 中时，PubMed 才能提供全文。PubMed 包含超过 3600 万条带摘要的引用，但 PMC 仅包含约 800 万篇全文文章。如果文章的全文不可用，Claude 可以在可用的情况下提供相关元数据（标题、作者、摘要），也可以提供指向完整文章的链接供您查阅。

数据的时效性如何？

PubMed 每天更新新的研究。该集成提供对 NCBI 数据库中最新可用数据的实时访问。

这是否适用于其他 NCBI 数据库？

该集成主要访问 PubMed 和 PubMed Central。不过，您可以通过请求 Claude 查找关联来发现来自其他 NCBI 数据库（如 Gene、Protein 和 Nucleotide 数据库）的相关数据。例如：

查找与这篇文章相关的基因

向我展示本文中引用的蛋白质序列

是否有与此研究相关联的核苷酸序列？

我应该了解哪些速率限制吗？

是的，该服务器有速率限制以遵守 NCBI 的准则。如果您收到速率限制提示消息，请稍等片刻后再试。

数据来自哪里？

所有数据均来自官方 NCBI 来源，但可能无法反映 NLM 提供的最新/最准确的数据：PubMed（美国国家医学图书馆的 MEDLINE 数据库）、PubMed Central（生物医学文献的免费全文档案库），以及 NCBI E-utilities API（访问 NCBI 数据库的官方编程接口）。

隐私和数据使用

  • PubMed 集成仅访问公开可用的研究文章
  • 通过该集成无法访问任何个人健康信息或患者数据
  • 您的搜索查询仅用于检索相关文章
  • 所有数据均来自官方 NCBI 来源

其他资源

需要更多帮助？

如果您在使用 PubMed 集成时遇到问题，或有本文未涉及的疑问，请联系 Claude 支持或访问我们的帮助中心获取更多故障排除指南。