在Claude中使用ChEMBL连接器

ChEMBL连接器使Claude能够访问EMBL-EBI的ChEMBL数据库，这是一个经过人工审编的数据库，收录了具有类药性质的生物活性分子、它们的生物靶点以及定量活性测量值。本文介绍如何设置和使用Claude中的ChEMBL集成，通过生物活性化合物数据加速药物发现。

ChEMBL集成依赖于Claude使用远程连接器的能力。

此集成提供的功能

此集成将Claude连接到ChEMBL的最新版本，这是由欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）维护的欧洲领先的开放获取药物发现数据库。ChEMBL包含超过200万种生物活性化合物、超过1500万条活性测量数据，以及来自76,000多篇科学出版物的数据，使其成为计算药物发现、靶点识别和制药研究的重要资源。

该连接器提供六个主要工具调用，可访问ChEMBL数据库的不同方面。

• compound_search 使用户能够通过名称、ChEMBL ID或化学结构（SMILES）查找分子，返回包括分子属性、同义词、批准状态和ATC分类在内的全面数据。
• target_search 通过名称、基因符号或生物体查询生物靶点（蛋白质、酶、受体），提供蛋白质登录号、基因本体注释以及与UniProt和其他数据库的交叉引用。
• get_bioactivity 检索化合物-靶点相互作用的定量活性测量值（IC50、EC50、Ki、Kd值），包括检测描述、pChEMBL评分、置信度评级以及来自同行评审期刊的文献参考。
• get_mechanism 访问已批准药物的人工审编作用机制数据，详细说明化合物如何与其生物靶点相互作用（例如“环氧合酶抑制剂”），并附有作用类型（抑制剂、激动剂、拮抗剂）和支持性参考文献。
• drug_search 使用MeSH疾病术语按治疗适应症查找已批准药物和临床候选药物，返回药物及其开发阶段、批准日期和安全警告。
• get_admet 提供对药物类似性评估至关重要的计算分子属性，包括亲脂性（ALogP）、极性表面积、氢键供体/受体、类五规则违反情况，以及QED类药性评分。

在提供方面，该连接器查询ChEMBL的RESTful API和SQL数据库，其中包含从药物化学文献、临床试验数据库和高通量筛选活动中提取的标准化、人工审编数据。所有生物活性数据都包括置信度评分、数据有效性标志，以及可追溯到原始出版物的完整来源记录。

谁应该使用ChEMBL集成

• 药物化学家： 通过分析构效关系（SAR）、对照类药性标准检查分子属性，以及识别具有更高效力或选择性的结构类似物，来设计和优化先导化合物。
• 药理学家： 研究药物作用机制、识别多药理学风险、发现脱靶效应，并通过检查跨蛋白质家族的生物活性特征来验证治疗靶点。
• 计算生物学家与化学信息学家： 构建用于活性预测的机器学习模型，开展虚拟筛选活动，训练QSAR模型，并在化学空间中进行大规模数据挖掘。
• 药物发现科学家： 识别经验证的药物靶点，为先导化合物优化寻找化学起点，对标竞争对手的化合物，并通过分析治疗领域内的已批准药物评估自由实施空间。
• 学术研究人员： 调查药物再利用机会，研究药物靶点之间的进化关系，分析临床开发成功率，并根据已有的生物活性数据验证研究结果。
• 制药项目团队： 对药物管线开展竞争情报分析，分析临床试验设计的终点，评估靶点可成药性，并在开发早期评估ADMET方面的不利因素。

设置ChEMBL集成

适用于组织所有者（团队版和企业版）

1. 导航到管理员设置 > 连接器
2. 点击“浏览连接器”
3. 点击“ChEMBL”
4. 点击“添加到您的团队”

适用于个人Claude用户

1. 导航到设置 > 连接器
2. 找到“ChEMBL”
3. 点击“连接”

了解如何在Claude中查找并连接工具。

适用于Claude Code用户

1. 按照上述步骤在Claude中连接ChEMBL
2. 使用相同的Claude账户登录Claude Code（运行/login以切换账户），然后重启Claude Code
3. 运行/mcp并检查该连接器是否出现在列表的claude.ai部分（如果未显示，请在该部分末尾选择显示未使用的连接器）

了解如何在Claude Code中使用来自Claude的连接器。

示例用例

基于靶点的药物发现

• 场景：为感兴趣的治疗靶点识别经过验证的化合物
• 示例提示：

化合物优化与构效关系分析

• 场景：通过研究构效关系来改进先导化合物的性质
• 示例提示：

竞争情报与药物再利用

• 场景：分析治疗格局并识别重新定位机会
• 示例提示：