Claude에서 Owkin 커넥터 사용하기

Owkin 커넥터는 H&E 병리 슬라이드를 약물 발견 및 개발, 임상 연구를 위한 조회 가능한 인사이트로 변환하는 Owkin AI 에이전트인 Pathology Explorer를 구동합니다. 이 문서에서는 병리학 기반 연구를 가속화하기 위해 Claude와 함께 Owkin 통합을 설정하고 사용하는 방법을 설명합니다.

Owkin 통합은 Claude의 원격 커넥터 사용 기능을 기반으로 합니다.

이 통합이 제공하는 것

Owkin은 약물 발견을 가속화하고, 임상 시험의 위험을 낮추고 가속화하기 위해 생물학을 위한 AI 에이전트를 구축합니다. Owkin 커넥터는 Claude가 TCGA 데이터베이스의 H&E 슬라이드를 세분화된 조회 가능한 인사이트로 변환하는 Owkin 에이전트인 Pathology Explorer에 접근할 수 있도록 합니다. 연구자들은 이를 사용하여 병리 이미지에서 세포 유형을 자동으로 감지하고, 종양 미세환경을 공간적으로 분석하며, 코호트 수준의 생존 분석을 통해 가설을 검증함으로써 약물 발견 및 개발의 위험을 낮추고 가속화할 수 있습니다.

Pathology Explorer는 Claude가 조직병리학 슬라이드를 분석할 수 있도록 다양한 기능을 제공합니다. 아래는 모델이 제공하는 슬라이드 수준 특징에 대한 상세 설명입니다.

개수 및 밀도 특징

각 세포 유형(림프구, 호중구, 형질세포, 섬유아세포, 호산구, 암세포)에 대해 모델은 다음을 제공합니다:

• count_{cell_type}: 슬라이드에서 감지된 지정된 세포 유형의 총 개수.
• global_density_{cell_type}: 조직의 단위 면적당 지정된 세포 유형의 밀도.

핵의 형태학적 특징

각 세포 유형에 대해 모델은 다음을 제공합니다:

• mean_area_{cell_type}: 슬라이드에서 지정된 세포 유형 핵의 평균 면적.
• mean_circularity_{cell_type}: 슬라이드에서 지정된 세포 유형 핵의 평균 원형도.
• mean_perimeter_{cell_type}: 슬라이드에서 지정된 세포 유형 핵의 평균 둘레.

공간 조직 특징

세 가지 영역 유형(종양, 종양 코어, 종양 코어 기질)에 대해 모델은 각 세포 유형별로 다음을 제공합니다:

• density_{cell_type}_in_{region}: 지정된 영역 내 지정된 세포 유형의 밀도.

각 영역에 대해 모델은 다음도 제공합니다:

• area_{region}: 슬라이드에서 지정된 영역의 면적.

또한, 생물학적으로 관련이 있는 세포 간 상호작용의 선택된 항목에 대해 모델은 다음을 제공합니다:

• average_co_occurrence_{cell_type}_{cell_type2}_rad_20.0um: 지정된 두 세포 유형의 핵이 20마이크로미터 반경 내에서 동시 발생하는 평균 빈도.

또한 모델은 슬라이드에 대한 종양 침윤 림프구 확산성을 정량화하는 지표인 tils_diffusivity를 계산합니다.

데이터세트에서 사용 가능한 코호트

이 특징들은 다음 TCGA 코호트에서 사용할 수 있습니다:

• TCGA_ACC
• TCGA_BLCA
• TCGA_BRCA
• TCGA_CESC
• TCGA_CHOL
• TCGA_COAD
• TCGA_DLBC
• TCGA_ESCA
• TCGA_HNSC
• TCGA_KICH
• TCGA_KIRC
• TCGA_KIRP
• TCGA_LIHC
• TCGA_LUAD
• TCGA_LUSC
• TCGA_MESO
• TCGA_OV
• TCGA_PAAD
• TCGA_PRAD
• TCGA_READ
• TCGA_SARC
• TCGA_STAD
• TCGA_THCA
• TCGA_THYM
• TCGA_UCEC
• TCGA_UCS

Owkin 통합을 사용해야 하는 대상

제약 연구자 및 의료 제공자(연구 목적 전용), 예를 들어:

• 중개 연구 및 면역종양학 연구자
• 신약 발견 팀
• 약물 개발 및 바이오마커 발견 팀
• 디지털 병리학 연구 그룹
• 동반 진단 개발 그룹

Owkin 통합에 접근할 수 있는 대상

커넥터에 접근하기 위한 전제 조건은 다음과 같습니다:

• K Pro 플랫폼에 접근 권한이 있는 계정 (제품 페이지, 가입 페이지)
• Claude.ai 또는 Claude Desktop에 대한 접근 권한

통합에 접근하는 방법에 대한 자세한 내용은 Owkin의 MCP 서버 문서에서 확인할 수 있습니다.

Owkin 통합 설정하기

조직 소유자(Team 및 Enterprise)의 경우

1. Admin settings > Connectors로 이동합니다
2. "Browse connectors"를 클릭합니다
3. "Owkin"을 클릭합니다
4. "Add to your team"을 클릭합니다

개인 Claude 사용자의 경우

1. Settings > Connectors로 이동합니다
2. "Owkin"을 찾습니다
3. "Connect"를 클릭합니다
4. 안내에 따라 Owkin 자격 증명을 입력하여 인증합니다

Claude에서 도구 찾기 및 연결하기에 대해 알아보세요.

Claude Code 사용자의 경우

1. 위 단계를 따라 Claude에서 Owkin을 연결합니다
2. 동일한 Claude 계정으로 Claude Code에 로그인한 다음(계정을 전환하려면 /login을 실행하세요) Claude Code를 재시작합니다
3. /mcp를 실행하여 목록의 claude.ai 섹션에 커넥터가 표시되는지 확인합니다(표시되지 않으면 해당 섹션 끝에서 Show unused connectors를 선택하세요)

Claude Code에서 Claude의 커넥터 사용하기에 대해 알아보세요.

Owkin 통합의 기술적 세부 사항은 Owkin의 MCP 서버 문서에서 확인할 수 있습니다.

사용 사례 예시

환자 계층화 개선. 6가지 뚜렷한 세포 유형(호중구 및 호산구와 같이 연구가 부족한 집단 포함)의 세밀한 프로파일링을 통해 범용 모델이 놓치는 환자 하위 그룹을 식별합니다. 공간 조직 분석을 활용하여 단순한 개수를 넘어선 TME 구조와 표현형을 특성화합니다.

예시 프롬프트:

전체 슬라이드 이미지 시각화. 채팅 인터페이스 내에서 직접 전체 슬라이드 이미지를 가져와 모델 출력에 대한 신뢰를 구축합니다.

예시 프롬프트:

H&E 기반 마커의 예후 가치 평가. 특정 세포 밀도나 공간 점수와 같은 특징을 기준으로 환자를 분할하여 코호트에 대한 생존 분석을 수행함으로써 임상 가설을 검증합니다.

예시 프롬프트:

재현성을 위한 정량적 증거 추출. 독립적인 검증이나 후속 분석을 위해 기본 원시 데이터를 가져와 AI가 생성한 인사이트에 대한 신뢰를 구축합니다.

예시 프롬프트:

Owkin의 Pathology Explorer 기능과 맥락 이해. 모델의 기술 사양을 직접 조회하여 모델에 대한 투명성을 확보합니다. 지원되는 세포 유형, 범암종 학습 데이터세트 등에 대해 알아보고 모델이 귀하의 연구 질문에 적합한지 확인하세요.

예시 프롬프트: