Claude에서 ChEMBL 커넥터 사용하기

ChEMBL 커넥터는 Claude가 EMBL-EBI의 ChEMBL 데이터베이스에 액세스할 수 있게 해줍니다. 이 데이터베이스는 약물과 유사한 특성을 가진 생리활성 분자, 이들의 생물학적 표적, 그리고 정량적 활성 측정값을 수작업으로 엄선한 저장소입니다. 이 문서에서는 ChEMBL 통합을 설정하고 Claude와 함께 사용하여 생리활성 화합물 데이터를 통해 신약 개발을 가속화하는 방법을 설명합니다.

ChEMBL 통합은 Claude의 원격 커넥터 사용 기능에 의존합니다.

이 통합이 제공하는 기능

이 통합은 Claude를 유럽 생물정보학 연구소(EMBL-EBI)가 관리하는 유럽 최고의 오픈 액세스 신약 개발 데이터베이스인 ChEMBL의 최신 버전에 연결합니다. ChEMBL은 200만 개 이상의 생리활성 화합물, 1,500만 건 이상의 활성 측정값, 76,000건 이상의 과학 논문 데이터를 포함하고 있어 전산 신약 개발, 표적 식별 및 제약 연구에 필수적인 자원입니다.

이 커넥터는 ChEMBL 데이터베이스의 다양한 측면에 액세스하는 여섯 가지 주요 도구 호출을 제공합니다.

• compound_search는 사용자가 이름, ChEMBL ID 또는 화학 구조(SMILES)로 분자를 찾을 수 있게 해주며, 분자 특성, 동의어, 승인 상태, ATC 분류를 포함한 포괄적인 데이터를 반환합니다.
• target_search는 이름, 유전자 기호 또는 유기체별로 생물학적 표적(단백질, 효소, 수용체)을 조회하여 단백질 접근 번호, 유전자 온톨로지 주석, UniProt 및 기타 데이터베이스에 대한 교차 참조를 제공합니다.
• get_bioactivity는 화합물-표적 상호작용에 대한 정량적 활성 측정값(IC50, EC50, Ki, Kd 값)을 검색하며, 분석 설명, pChEMBL 점수, 신뢰도 등급, 동료 심사를 거친 저널의 문헌 참조를 포함합니다.
• get_mechanism은 승인된 약물에 대해 수작업으로 엄선한 작용 기전 데이터에 액세스하여 화합물이 생물학적 표적과 어떻게 상호작용하는지(예: "사이클로옥시게나아제 억제제") 작용 유형(INHIBITOR, AGONIST, ANTAGONIST)과 근거 참조와 함께 상세히 설명합니다.
• drug_search는 MeSH 질환 용어를 사용하여 치료 적응증별로 승인된 약물과 임상 후보 물질을 찾으며, 개발 단계, 승인 날짜, 안전성 경고와 함께 약물을 반환합니다.
• get_admet은 친유성(ALogP), 극성 표면적, 수소 결합 공여체/수용체, Rule of Five 위반 사항, QED 약물성 점수를 포함하여 약물성 평가에 중요한 계산된 분자 특성을 제공합니다.

공급자 측에서는 이 커넥터가 의약화학 문헌, 임상 시험 데이터베이스, 고처리량 스크리닝 캠페인에서 추출한 표준화되고 수작업으로 엄선된 데이터를 포함하는 ChEMBL의 RESTful API 및 SQL 데이터베이스를 쿼리합니다. 모든 생리활성 데이터에는 신뢰도 점수, 데이터 유효성 플래그, 원본 출판물까지 추적 가능한 전체 출처 정보가 포함됩니다.

ChEMBL 통합을 사용해야 하는 대상

• 의약화학자: 구조-활성 관계(SAR)를 분석하고, 약물성 기준에 따라 분자 특성을 확인하며, 역가나 선택성이 개선된 구조 유사체를 식별하여 선도 화합물을 설계하고 최적화합니다.
• 약리학자: 약물 작용 기전을 연구하고, 다약리학적 위험을 식별하며, 표적 외 효과를 발견하고, 단백질 계열 전반의 생리활성 프로필을 검토하여 치료 표적을 검증합니다.
• 전산 생물학자 및 화학정보학자: 활성 예측을 위한 머신러닝 모델을 구축하고, 가상 스크리닝 캠페인을 수행하며, QSAR 모델을 훈련하고, 화학 공간 전반에서 대규모 데이터 마이닝을 수행합니다.
• 신약 개발 과학자: 검증된 약물 표적을 식별하고, 히트-리드 최적화를 위한 화학적 시작점을 찾으며, 경쟁사 화합물을 벤치마킹하고, 치료 영역의 승인된 약물을 분석하여 자유 운용성을 평가합니다.
• 학술 연구자: 약물 재창출 기회를 조사하고, 약물 표적 간의 진화적 관계를 연구하며, 임상 개발 성공률을 분석하고, 확립된 생리활성 데이터와 비교하여 연구 결과를 검증합니다.
• 제약 프로젝트 팀: 약물 파이프라인에 대한 경쟁 정보를 수집하고, 임상 시험 설계를 위한 평가 항목을 분석하며, 표적 추적 가능성을 평가하고, 개발 초기 단계에서 ADMET 부담을 평가합니다.

ChEMBL 통합 설정하기

조직 소유자(Team 및 Enterprise)의 경우

1. 관리자 설정 > 커넥터로 이동합니다
2. "커넥터 찾아보기"를 클릭합니다
3. "ChEMBL"을 클릭합니다
4. "팀에 추가"를 클릭합니다

개인 Claude 사용자의 경우

1. 설정 > 커넥터로 이동합니다
2. "ChEMBL"을 찾습니다
3. "연결"을 클릭합니다

Claude에서 도구 찾기 및 연결하기에 대해 알아보세요.

Claude Code 사용자의 경우

1. 위의 단계를 따라 Claude에서 ChEMBL을 연결합니다
2. 동일한 Claude 계정으로 Claude Code에 로그인한 다음(계정을 전환하려면 /login을 실행하세요) Claude Code를 다시 시작합니다
3. /mcp를 실행하여 목록의 claude.ai 섹션에 커넥터가 표시되는지 확인합니다(표시되지 않으면 해당 섹션 끝에 있는 사용하지 않는 커넥터 표시를 선택하세요)

Claude Code에서 Claude의 커넥터 사용하기에 대해 알아보세요.

사용 사례 예시

표적 기반 신약 개발

• 시나리오: 관심 있는 치료 표적에 대해 검증된 화합물 식별하기
• 샘플 프롬프트:

화합물 최적화 및 SAR 분석

• 시나리오: 구조-활성 관계를 연구하여 선도 화합물 특성 개선하기
• 샘플 프롬프트:

경쟁 정보 및 약물 재창출

• 시나리오: 치료 영역을 분석하고 재배치 기회 식별하기
• 샘플 프롬프트: