Sage BionetworksによるSynapse.org連携により、研究者はSynapse全体で生物医学データを発見し、プロジェクトの構造を確認し、認可されたユーザーとしてデータアセットに関する情報を取得できます。本記事では、研究や分析のワークフローを進めるために、Synapse.org連携をClaudeでセットアップし、使用する方法を説明します。
Synapse.org連携は、Claudeのリモートコネクタを使用する(新しいタブで開きます)機能に依存しています。
この連携が提供するもの
サービスには、検索および(メタ)データ取得サービスが含まれます。データへのアクセスは、各プロジェクトで定義されたアクセス制御によって管理されます。データの中には一般に公開されているものもあれば、アクセス前にSynapseのガバナンスチームによる承認が必要なものもあります。
Synapse.org連携にアクセスできるユーザー
- 登録済みのSynapseアカウントを持つ個人(無料登録はこちら(新しいタブで開きます))
- データへのアクセスは、提供者による利用制限の対象となる場合があります
連携へのアクセスに関する詳細は、SynapseのMCPサーバードキュメント(新しいタブで開きます)に記載されています。
Synapse.org連携の設定
組織オーナー向け(TeamおよびEnterprise)
- 管理設定 > コネクタに移動します
- 「コネクタを閲覧」をクリックします
- 「Synapse.org」をクリックします
- 「チームに追加」をクリックします
個人のClaudeユーザー向け
- 設定 > コネクタに移動します
- 「接続」をクリックします
- 指示に従ってSynapse.orgアカウントで認証します
Claudeでのツールの検索と接続(新しいタブで開きます)について詳しくはこちらをご覧ください。
Claude Codeユーザー向け
- 上記の手順に従って、ClaudeでSynapse.orgを接続します
- 同じClaudeアカウントでClaude Codeにサインインし(アカウントを切り替えるには
/loginを実行します)、その後Claude Codeを再起動します /mcpを実行し、リストのclaude.aiセクションにコネクタが表示されていることを確認します(表示されていない場合は、そのセクションの最後にある未使用のコネクタを表示を選択してください)
Claude CodeでClaudeのコネクタを使用する(新しいタブで開きます)方法について詳しくはこちらをご覧ください。
Synapse.org連携の技術的な詳細は、SynapseのMCPサーバードキュメント(新しいタブで開きます)に記載されています。
一般的な利用例
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Synapse.orgプラットフォーム全体で再利用可能な科学データを検索する
Synapseでアルツハイマー病に関連するRNA-seqデータセットを探して
Synapseでシングルセルトランスクリプトミクスデータセットを検索して
NF Data Portalで叢状神経線維腫のゲノムシーケンシングデータを探して
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認可されたユーザーは、プロジェクト内のフォルダ、ファイル、テーブル、データセットの階層を確認でき、データアセットの整理や監視に役立てることができます
公開されているAACR Project GENIEプロジェクトのファイルとフォルダについて説明して
agentic trackを持つSEA-ADチャレンジプロジェクト(syn66496696)のデータアセットについて簡単に概要を教えて
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Synapse内のエンティティのカスタムメタデータを取得する
ファイルsyn4553239のアノテーションとメタデータは何ですか?
データセットsyn66364675のカスタムメタデータフィールドを見せて
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Synapse内のエンティティの来歴情報を取得し、過去のデータ処理の理解に役立てる
ファイルsyn51543273の処理履歴は何ですか?
データセットsyn68719289のデータリネージとアップストリーム依存関係を見せて