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ClaudeでPubMedコネクタを使用する

何百万もの生物医学研究論文や臨床研究にアクセスできるよう、ClaudeのPubMed連携を設定して使用します。

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PubMed連携により、何百万もの生物医学研究論文や臨床研究にアクセスできるようになり、Claudeは要旨や論文全文を参照して、実験アプローチを明確にしたり、主要な知見を特定したり、新規性や適用可能性を判断したり、より深く調査するための特定の論文を見つけ出したりすることができます。この記事では、研究ワークフローを加速するために、ClaudeでPubMed連携を設定して使用する方法を説明します。

PubMed連携は、Claudeのリモートコネクタの使用機能に依存しています。

この連携が提供するもの

PubMed連携により、Claudeは米国国立医学図書館が管理するPubMedデータベースに直接接続できます。3,600万件を超える生物医学文献の引用情報を有するPubMedは、医学研究、科学研究、健康情報に関する第一級のリソースです。

この連携により、次のことが可能になります。

  • キーワード、著者、ジャーナル、または高度なクエリ構文を使用した研究論文の検索
  • 要旨、著者、出版日、引用情報、論文全文へのリンクを含む、完全な論文メタデータの取得
  • 利用可能な場合のPubMed Central（PMC）からの全文論文へのアクセス
  • NCBIの各種データベース全体にわたる関連論文の検索
  • 検証および参照のための、引用情報とPubMed IDの照合
  • ID形式（PMID、PMC ID、DOI）間の変換

PubMed連携の設定

組織オーナー向け（TeamおよびEnterprise）

  1. 管理設定 > コネクタに移動します
  2. 「Browse connectors」をクリックします
  3. 「PubMed」をクリックします
  4. 「Add to your team」をクリックします

個人のClaudeユーザー向け

  1. 設定 > コネクタに移動します
  2. 「PubMed」を探します
  3. 「Connect」をクリックします

Claudeでのツールの検索と接続について詳しく学びます。

Claude Codeユーザー向け

  1. 上記の手順に従って、ClaudeでPubMedを接続します
  2. 同じClaudeアカウントでClaude Codeにサインインし（アカウントを切り替えるには/loginを実行します）、その後Claude Codeを再起動します
  3. /mcpを実行し、コネクタがリストのclaude.aiセクションに表示されていることを確認します（表示されていない場合は、そのセクションの末尾にある未使用のコネクタを表示を選択します）

Claude CodeでClaudeのコネクタを使用する方法について詳しく学びます。

Messages APIでPubMed MCPを使用する

開発者は、MCPコネクタを使用してClaudeのMessages APIから直接PubMed連携に接続できます。これにより、PubMedの検索機能をプログラムで活用するアプリケーションを構築できます。

要件

Anthropic APIキー

ベータヘッダー: anthropic-beta: mcp-client-2025-11-20

設定

リクエストの例

python
import anthropic

client = anthropic.Anthropic()

response = client.beta.messages.create(
    model="claude-sonnet-5-5",
    max_tokens=4096,
    messages=[{"role": "user", "content": "Find recent papers on CRISPR gene editing in cancer treatment"}],
    mcp_servers=[{"type": "url", "url": "https://pubmed.mcp.claude.com/mcp", "name": "pubmed"}],
    tools=[{"type": "mcp_toolset", "mcp_server_name": "pubmed"}],
    betas=["mcp-client-2025-11-20"]
)

よくある使用例

研究論文の検索

Claudeに、興味のある生物医学または科学的なトピックに関する論文を探すよう依頼します。プロンプトの例:

黒色腫の免疫療法に関する最近の研究を見つけて

先月発表されたCRISPR遺伝子編集に関する研究を見せて

私が取り組んでいる提案や遺伝子に関連する文献を見つけて

論文の詳細とメタデータの取得

特定の論文に関する包括的な情報を取得します。プロンプトの例:

このトピックで最も引用されている論文は何ですか？

このトピックに関する最新の論文を見つけて、この分野への新しい貢献を要約してもらえますか？

その研究の著者は誰でしたか？

その論文はいつ発表されましたか？

論文全文へのアクセス

PubMed Centralで利用可能な論文については、その全文を取得して研究に役立てます。プロンプトの例:

この2つの論文の手法を比較して

これらの論文に共通する結論は何で、どこが異なっていましたか？

これらの論文を読んで、私の仮説にとって最も重要な結論を特定するのを手伝って

関連論文の検索

NCBIの各種データベース全体で類似の研究を見つけます。プロンプトの例:

この論文と似た研究を見つけて

この研究の知見を、この分野の他の研究と比較して

引用情報とPubMed IDの照合

引用情報を検証し、ジャーナル参照からPubMed IDを見つけます。プロンプトの例:

次の引用を調べて: Smith J, Nature 2020, vol 52, page 811

私の参考文献リストにあるこの参照について、PubMedのエントリを見つけて

ある論文からの引用情報があるのですが、PubMedで見つけてもらえますか？

このPMIDに関連する論文について話し合いたいです

よくある質問

PubMed連携は無料で使えますか？

はい！この連携はすべてのClaudeユーザーが無料で利用できます。PubMedは米国国立医学図書館が提供する無料の公開リソースです。

どの論文でも全文にアクセスできますか？

PubMedは、PubMed Central（PMC）に掲載されている論文のみ全文を利用可能にしています。PubMedには3,600万件を超える引用情報と要旨がありますが、PMCには約800万件の全文論文があります。論文の全文が利用できない場合、Claudeは利用可能であれば関連するメタデータ（タイトル、著者、要旨）を提供し、確認用に論文全文へのリンクを提供することもできます。

データはどのくらい最新ですか？

PubMedは毎日新しい研究で更新されています。この連携は、NCBIデータベースから入手可能な最新のデータにリアルタイムでアクセスできます。

他のNCBIデータベースでも動作しますか？

この連携は主にPubMedとPubMed Centralにアクセスします。ただし、Claudeに関連を調べるよう依頼することで、他のNCBIデータベース（Gene、Protein、Nucleotideデータベースなど）から関連データを見つけることができます。例:

この論文に関連する遺伝子を見つけて

この論文で参照されているタンパク質配列を見せて

この研究に関連するヌクレオチド配列はありますか？

知っておくべきレート制限はありますか？

はい、このサーバーにはNCBIのガイドラインに準拠するためのレート制限があります。レート制限のメッセージを受け取った場合は、少し待ってから再度お試しください。

データはどこから取得されていますか？

すべてのデータは公式のNCBIソースから取得されていますが、NLMから入手可能な最新・最も正確なデータを反映していない場合があります。具体的には、PubMed（米国国立医学図書館のMEDLINEデータベース）、PubMed Central（生物医学文献の無料全文アーカイブ）、およびNCBI E-utilities API（NCBIデータベースへの公式なプログラムによるアクセス）です。

プライバシーとデータの利用

  • PubMed連携は、公開されている研究論文にのみアクセスします
  • この連携を通じて、個人の健康情報や患者データにアクセスされることはありません
  • 検索クエリは、関連論文の取得のためにのみ使用されます
  • すべてのデータは公式のNCBIソースから取得されています

その他のリソース

さらにサポートが必要ですか？

PubMed連携で問題が発生している場合や、ここで取り上げられていない質問がある場合は、Claudeサポートにお問い合わせいただくか、追加のトラブルシューティングガイドについてはヘルプセンターをご覧ください。