L'intégration Synapse.org par Sage Bionetworks permet aux chercheurs de découvrir des données biomédicales sur l'ensemble de Synapse, de visualiser la structure des projets et de récupérer des informations sur leurs ressources de données pour les utilisateurs autorisés. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration Synapse.org avec Claude pour faire progresser vos flux de travail de recherche et d'analyse.
L'intégration Synapse.org repose sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs distants(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Ce que fournit cette intégration
Les services incluent des services de recherche et de récupération de (méta)données. L'accès aux données sera régi par les contrôles d'accès définis pour chaque projet. Certaines données sont disponibles publiquement, tandis que d'autres nécessitent l'approbation de l'équipe de gouvernance de Synapse avant d'y accéder.
Qui peut accéder à l'intégration Synapse.org
- Les personnes disposant d'un compte Synapse enregistré (inscrivez-vous gratuitement(s’ouvre dans un nouvel onglet))
- L'accès aux données peut être soumis à des restrictions d'utilisation de la part des contributeurs
Vous trouverez plus de détails sur l'accès à l'intégration dans la documentation du serveur MCP de Synapse(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Configuration de l'intégration Synapse.org
Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)
- Accédez à Paramètres d'administration > Connecteurs
- Cliquez sur « Parcourir les connecteurs »
- Cliquez sur « Synapse.org »
- Cliquez sur « Ajouter à votre équipe »
Pour les utilisateurs individuels de Claude
- Accédez à Paramètres > Connecteurs
- Cliquez sur « Connecter »
- Suivez les instructions pour vous authentifier avec votre compte Synapse.org
Découvrez comment trouver et connecter des outils(s’ouvre dans un nouvel onglet) dans Claude.
Pour les utilisateurs de Claude Code
- Connectez Synapse.org dans Claude en suivant les étapes ci-dessus
- Connectez-vous à Claude Code avec le même compte Claude (exécutez
/loginpour changer de compte), puis redémarrez Claude Code - Exécutez
/mcpet vérifiez que le connecteur apparaît dans la section claude.ai de la liste (s'il n'est pas affiché, sélectionnez Afficher les connecteurs inutilisés à la fin de cette section)
Découvrez comment utiliser les connecteurs de Claude dans Claude Code(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Les détails techniques de l'intégration Synapse.org se trouvent dans la documentation du serveur MCP de Synapse(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Cas d'usage courants
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Rechercher des données scientifiques réutilisables sur l'ensemble de la plateforme Synapse.org
Trouver des jeux de données RNA-seq liés à la maladie d'Alzheimer dans Synapse
Rechercher dans Synapse des jeux de données de transcriptomique unicellulaire
Trouver des données de séquençage génomique pour les neurofibromes plexiformes dans le NF Data Portal
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Les utilisateurs autorisés peuvent voir la hiérarchie des dossiers, fichiers, tableaux et jeux de données au sein des projets pour aider à organiser et surveiller les ressources de données
Expliquer les fichiers et dossiers du projet public AACR Project GENIE
Donne-moi un aperçu rapide des ressources de données dans le projet de challenge SEA-AD avec le parcours agentique (syn66496696) ?
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Obtenir les métadonnées personnalisées des entités dans Synapse
Quelles sont les annotations et métadonnées du fichier syn4553239 ?
Montre-moi les champs de métadonnées personnalisées du jeu de données syn66364675
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Obtenir des informations de provenance pour les entités dans Synapse afin de mieux comprendre les traitements de données passés
Quel est l'historique de traitement du fichier syn51543273 ?
Montre-moi la lignée des données et les dépendances en amont du jeu de données syn68719289