Utilisation du connecteur PubMed dans Claude

L'intégration PubMed donne accès à des millions d'articles de recherche biomédicale et d'études cliniques, permettant à Claude d'accéder aux résumés et aux articles complets afin de clarifier les approches expérimentales, d'identifier les principales conclusions, de déterminer la nouveauté et l'applicabilité, et de mettre en avant des articles spécifiques pour une exploration plus approfondie. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration PubMed avec Claude afin d'accélérer vos flux de travail de recherche.

L'intégration PubMed s'appuie sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs distants.

Ce que fournit cette intégration

L'intégration PubMed connecte Claude directement à la base de données PubMed maintenue par la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis (U.S. National Library of Medicine). Avec plus de 36 millions de citations de littérature biomédicale, PubMed est la ressource de référence pour la recherche médicale, les études scientifiques et les informations de santé.

Cette intégration vous permet de :

• Rechercher des articles de recherche à l'aide de mots-clés, d'auteurs, de revues ou d'une syntaxe de requête avancée
• Obtenir les métadonnées complètes des articles, notamment les résumés, les auteurs, les dates de publication, les citations et les liens vers l'article complet
• Accéder aux articles en texte intégral de PubMed Central (PMC) lorsqu'ils sont disponibles
• Trouver des articles connexes dans les bases de données du NCBI
• Faire correspondre des citations à des identifiants PubMed à des fins de vérification et de référencement
• Convertir entre les formats d'identifiants (PMID, PMC ID, DOI)

Configuration de l'intégration PubMed

Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)

1. Accédez à Paramètres d'administration > Connecteurs
2. Cliquez sur « Parcourir les connecteurs »
3. Cliquez sur « PubMed »
4. Cliquez sur « Ajouter à votre équipe »

Pour les utilisateurs individuels de Claude

1. Accédez à Paramètres > Connecteurs
2. Trouvez « PubMed »
3. Cliquez sur « Connecter »

Pour en savoir plus sur la recherche et la connexion d'outils dans Claude.

Pour les utilisateurs de Claude Code

1. Connectez PubMed dans Claude en suivant les étapes ci-dessus
2. Connectez-vous à Claude Code avec le même compte Claude (exécutez /login pour changer de compte), puis redémarrez Claude Code
3. Exécutez /mcp et vérifiez que le connecteur apparaît dans la section claude.ai de la liste (s'il n'est pas affiché, sélectionnez Show unused connectors à la fin de cette section)

Pour en savoir plus sur l'utilisation des connecteurs depuis Claude dans Claude Code.

Utilisation du MCP PubMed avec l'API Messages

Les développeurs peuvent se connecter à l'intégration PubMed directement via l'API Messages de Claude à l'aide du connecteur MCP. Cela vous permet de créer des applications qui exploitent les capacités de recherche de PubMed de manière programmatique.

Prérequis

Une clé API Anthropic

L'en-tête bêta : anthropic-beta: mcp-client-2025-11-20

Configuration

Exemple de requête

import anthropic

client = anthropic.Anthropic()

response = client.beta.messages.create(
    model="claude-sonnet-5-5",
    max_tokens=4096,
    messages=[{"role": "user", "content": "Find recent papers on CRISPR gene editing in cancer treatment"}],
    mcp_servers=[{"type": "url", "url": "https://pubmed.mcp.claude.com/mcp", "name": "pubmed"}],
    tools=[{"type": "mcp_toolset", "mcp_server_name": "pubmed"}],
    betas=["mcp-client-2025-11-20"]
)

Cas d'usage courants

Rechercher des articles de recherche

Demandez à Claude de trouver des articles sur des sujets biomédicaux ou scientifiques qui vous intéressent. Exemples de requêtes :

Obtenir les détails et les métadonnées d'un article

Récupérez des informations complètes sur des articles spécifiques. Exemples de requêtes :

Accéder aux articles en texte intégral

Pour les articles disponibles dans PubMed Central, récupérez le texte complet des articles pour faciliter vos recherches. Exemples de requêtes :

Trouver des articles connexes

Découvrez des recherches similaires dans les bases de données du NCBI. Exemples de requêtes :

Faire correspondre des citations à des identifiants PubMed

Vérifiez des citations et trouvez des identifiants PubMed à partir de références de revues. Exemples de requêtes :

Questions fréquentes

L'intégration PubMed est-elle gratuite ?

Oui ! L'intégration est gratuite pour tous les utilisateurs de Claude. PubMed est une ressource publique gratuite fournie par la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis (U.S. National Library of Medicine).

Puis-je accéder au texte intégral de n'importe quel article ?

PubMed ne met le texte intégral des articles à disposition que s'ils figurent dans PubMed Central (PMC). PubMed contient plus de 36 millions de citations avec résumés, mais PMC contient environ 8 millions d'articles en texte intégral. Lorsque le texte intégral d'un article n'est pas disponible, Claude peut fournir les métadonnées pertinentes (titre, auteurs, résumé) si elles sont disponibles, et peut également fournir un lien vers l'article complet pour votre consultation.

Les données sont-elles à jour ?

PubMed est mise à jour quotidiennement avec de nouvelles recherches. L'intégration fournit un accès en temps réel aux données les plus récentes disponibles dans les bases de données du NCBI.

Cela fonctionne-t-il avec d'autres bases de données du NCBI ?

L'intégration accède principalement à PubMed et PubMed Central. Cependant, vous pouvez découvrir des données connexes dans d'autres bases de données du NCBI (comme les bases de données Gene, Protein et Nucleotide) en demandant à Claude de trouver des liens. Par exemple :

Existe-t-il des limites de débit à connaître ?

Oui, le serveur applique des limites de débit pour se conformer aux directives du NCBI. Si vous recevez un message de limite de débit, attendez un court instant puis réessayez.

D'où proviennent les données ?

Toutes les données proviennent de sources officielles du NCBI, mais peuvent ne pas refléter les données les plus récentes/exactes disponibles auprès de la NLM : PubMed (la base de données MEDLINE de la National Library of Medicine), PubMed Central (archive gratuite en texte intégral de littérature biomédicale) et l'API NCBI E-utilities (accès programmatique officiel aux bases de données du NCBI).

Confidentialité et utilisation des données

• L'intégration PubMed n'accède qu'à des articles de recherche accessibles au public
• Aucune information de santé personnelle ni donnée patient n'est accessible via cette intégration
• Vos requêtes de recherche sont utilisées uniquement pour récupérer les articles pertinents
• Toutes les données proviennent de sources officielles du NCBI

Ressources supplémentaires

• Générateur de recherche avancée PubMed : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/advanced/
• Base de données MeSH : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
• Documentation NCBI E-utilities : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/

Besoin d'aide supplémentaire ?

Si vous rencontrez des problèmes avec l'intégration PubMed ou si vous avez des questions qui ne sont pas abordées ici, veuillez contacter le support Claude ou consulter notre centre d'aide pour obtenir des guides de dépannage supplémentaires.