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Utilisation du connecteur Open Targets dans Claude

Configurez et utilisez l'intégration Open Targets avec Claude pour explorer les données à l'appui, prioriser les cibles médicamenteuses et évaluer les associations avec les maladies.

10 minClaude

Ce connecteur donne accès à la plateforme Open Targets permettant d'identifier et de prioriser les cibles thérapeutiques médicamenteuses en fonction des associations avec les maladies. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration Open Targets avec Claude afin d'explorer plus rapidement les données à l'appui et de prioriser les cibles médicamenteuses et d'évaluer les associations avec les maladies.

L'intégration Open Targets s'appuie sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs distants.

Ce que fournit cette intégration

Le connecteur Open Targets fournit une interface et des instructions spécialement conçues pour accéder aux données et analyses de la plateforme Open Targets et les interpréter.

La plateforme Open Targets est un outil complet qui permet l'identification et la priorisation systématiques de cibles thérapeutiques médicamenteuses potentielles, en intégrant des ensembles de données accessibles au public pour construire et noter les associations cible-maladie. Elle intègre également des informations d'annotation pertinentes sur les cibles, les maladies/phénotypes, les médicaments, les variants, les études GWAS et de QTL moléculaires, ainsi que les ensembles crédibles (credible sets) et leurs relations les plus pertinentes.

Cet outil rend l'API GraphQL de la plateforme Open Targets accessible en lecture seule, et inclut toutes les sources répertoriées dans la documentation de la plateforme Open Targets.

À qui s'adresse l'intégration Open Targets

  • Scientifiques en découverte de cibles : identification de nouvelles cibles thérapeutiques
  • Directeurs de recherche/responsables d'équipe ou de projet/gestionnaires de portefeuille : prise de décisions stratégiques et gestion de portefeuille
  • Chercheurs universitaires, à tous les niveaux : comparaison de leurs données avec des données existantes, par exemple la visualisation des preuves d'association et des analyses de priorisation pour une liste de cibles qu'ils ont générée
  • Bio-informaticiens/ingénieurs de données/ingénieurs en apprentissage automatique/équipes informatiques R&D : intégration des données Open Targets avec des ensembles de données propriétaires, création de plateformes et de solutions de données internes, entraînement de modèles sur des données biologiques

Qui peut accéder à l'intégration Open Targets

Les données de la plateforme Open Targets accessibles via le connecteur sont disponibles pour un usage académique et commercial. La plateforme Open Targets est marquée CC0 1.0 ; cela place les données dans le domaine public, permettant aux utilisateurs en aval de les exploiter sans restriction. Pour plus d'informations, consultez la documentation de licence de la plateforme Open Targets.

Le code du connecteur lui-même est sous licence Apache 2.0.

Des informations complémentaires sur l'accès à l'intégration sont disponibles dans la documentation du serveur MCP d'Open Targets.

Configuration de l'intégration Open Targets

Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)

  1. Accédez à Paramètres administrateur > Connecteurs
  2. Cliquez sur « Parcourir les connecteurs »
  3. Cliquez sur « Open Targets »
  4. Cliquez sur « Ajouter à votre équipe »

Pour les utilisateurs individuels de Claude

  1. Accédez à Paramètres > Connecteurs
  2. Trouvez « Open Targets »
  3. Cliquez sur « Connecter »

Découvrez comment trouver et connecter des outils dans Claude.

Pour les utilisateurs de Claude Code

  1. Connectez Open Targets dans Claude en suivant les étapes ci-dessus
  2. Connectez-vous à Claude Code avec le même compte Claude (exécutez /login pour changer de compte), puis redémarrez Claude Code
  3. Exécutez /mcp et vérifiez que le connecteur apparaît dans la section claude.ai de la liste (s'il n'est pas affiché, sélectionnez Afficher les connecteurs inutilisés à la fin de cette section)

Découvrez comment utiliser les connecteurs de Claude dans Claude Code.

Les détails techniques de l'intégration Open Targets sont disponibles dans la documentation du serveur MCP d'Open Targets.

Exemples de cas d'usage

Chercheur en découverte de cibles étudiant une maladie

  • Un chercheur en neurosciences au sein de l'équipe de découverte précoce d'une entreprise pharmaceutique, explorant de nouvelles cibles thérapeutiques pour la maladie d'Alzheimer. Il doit évaluer quelles cibles présentent les preuves d'association les plus solides avec la maladie et comprendre les types de preuves à l'appui. Il peut ensuite vouloir prioriser davantage les cibles en fonction des preuves.
  • Exemple de requête :

Quelles sont les cinq principales cibles associées à la maladie d'Alzheimer ?

  • La plateforme fournit une liste classée des cibles en fonction des scores d'association globaux et une répartition des preuves selon plusieurs types de données. À partir de là, l'utilisateur peut poser d'autres questions sur les cibles et les preuves.

Généticien statisticien parcourant des études

  • Un généticien statisticien d'un institut de recherche académique étudie les variants génétiques associés à la maladie d'Alzheimer à début précoce. Il passe en revue les preuves génétiques existantes pour PSEN1 et doit comprendre quelles études d'association pangénomique (GWAS) ont été menées, quels sont les variants les plus probablement causaux, quelles populations ont été étudiées, et comment ces résultats se comparent entre les différentes études.
  • Exemple de requête :

Disposez-vous de preuves GWAS pour PSEN1 ? Quelles études existent ?

  • La plateforme peut fournir une liste d'études et d'ensembles crédibles (credible sets) contenant PSEN1, avec des informations au niveau des variants et des métadonnées d'étude, ainsi que des liens vers les publications originales. L'utilisateur peut ensuite interroger plus en détail les informations contenues dans ces études et ensembles crédibles.

Priorisation des cibles à l'aide de données de sécurité

  • Un scientifique en recherche translationnelle au sein d'un comité de sélection de cibles évalue des cibles médicamenteuses potentielles pour un programme anti-inflammatoire. Il doit comprendre le profil de sécurité associé au ciblage de cette protéine afin d'éclairer les discussions sur le rapport risque/bénéfice, notamment les événements indésirables et problèmes de sécurité connus, les preuves issues des essais cliniques, la pharmacovigilance post-commercialisation et les études génétiques.
  • Exemple de requête :

Existe-t-il des événements de sécurité connus associés au ciblage de PTGS2 ?

  • La plateforme fournit des informations de sécurité complètes provenant de multiples sources, que l'utilisateur peut explorer plus en détail, et comparer les informations entre différentes cibles.