L'intégration 10x Genomics transforme l'analyse unicellulaire et spatiale en un flux de travail conversationnel simple. Les biologistes peuvent facilement analyser leurs propres données de séquençage, tandis que les laboratoires centraux peuvent rapidement effectuer un traitement par lots. Cet article explique comment configurer et utiliser l'intégration 10x Genomics avec Claude pour faire progresser vos flux de travail d'analyse.
L'intégration 10x Genomics est disponible en tant qu'extension de bureau dans l'application Claude Desktop (télécharger ici(s’ouvre dans un nouvel onglet)), et elle s'appuie sur la capacité de Claude à utiliser des connecteurs locaux via une extension de bureau(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Ce que propose cette intégration
L'intégration 10x Genomics permet aux chercheurs de créer et de gérer des flux de travail d'analyse génomique unicellulaire en conversation avec Claude. Les utilisateurs peuvent télécharger des données, configurer et lancer des pipelines Cell Ranger, surveiller l'état des analyses et télécharger les résultats à l'aide de requêtes en langage naturel plutôt que d'outils en ligne de commande ou d'interfaces web. L'intégration traduit les requêtes conversationnelles en actions sur la plateforme 10x Cloud Analysis, simplifiant les flux de travail pour les analyses d'expression génique, de multiplexage cellulaire et de criblage CRISPR.
Qui devrait utiliser l'intégration 10x Genomics
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Biologistes computationnels : chercheurs qui analysent des données génomiques unicellulaires et souhaitent simplifier les flux de travail d'analyse basés sur le cloud
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Bio-informaticiens : scientifiques qui traitent plusieurs échantillons et ont besoin de capacités de traitement par lots efficaces
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Chercheurs scientifiques : chercheurs de laboratoire qui génèrent des données unicellulaires et souhaitent une interface intuitive pour exécuter des pipelines standard
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Responsables de plateformes centrales : personnel qui traite des échantillons pour plusieurs groupes de recherche et doit gérer de nombreuses analyses
Qui peut accéder à l'intégration 10x Genomics
Tout utilisateur disposant d'un compte 10x Cloud Analysis (créer un compte gratuit ici(s’ouvre dans un nouvel onglet))
Vous trouverez plus de détails sur l'accès à l'intégration dans la documentation du serveur MCP 10x Genomics(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Configuration de l'intégration 10x Genomics
L'intégration 10x Genomics est disponible en tant qu'extension de bureau dans l'application Claude Desktop (télécharger ici(s’ouvre dans un nouvel onglet)). Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise), la configuration de l'intégration consiste à rendre l'extension disponible pour votre organisation. Pour les utilisateurs individuels, la configuration de l'intégration consiste à installer l'extension depuis l'application Claude Desktop.
Pour les propriétaires d'organisation (Team et Enterprise)
Si votre organisation utilise la liste d'autorisation des extensions de bureau (c'est-à-dire qu'elle restreint les extensions de bureau auxquelles les utilisateurs peuvent accéder)…
- Accédez à Paramètres d'administration > Connecteurs
- Cliquez sur l'onglet « Desktop » en haut
- Vérifiez que « Liste d'autorisation » est activée (on)
- Cliquez sur le bouton « Parcourir »
- Dans le champ de recherche, saisissez « 10x Genomics »
- Cliquez sur 10x Genomics
- Cliquez sur « Ajouter à votre équipe »
- Demandez à votre équipe de télécharger l'application Claude Desktop(s’ouvre dans un nouvel onglet) pour accéder à l'intégration en suivant les instructions ci-dessous destinées aux utilisateurs individuels de Claude
Si votre organisation n'utilise pas la liste d'autorisation des extensions de bureau (c'est-à-dire qu'elle ne restreint pas les extensions de bureau auxquelles les utilisateurs peuvent accéder)…
- Accédez à Paramètres d'administration > Connecteurs
- Cliquez sur l'onglet « Desktop » en haut
- Vérifiez que « Liste d'autorisation » est désactivée (off)
- Si la liste d'autorisation est désactivée, tous les utilisateurs de votre organisation pourront déjà accéder au répertoire des extensions de bureau en suivant les instructions ci-dessous destinées aux utilisateurs individuels de Claude
Pour les utilisateurs individuels de Claude
- Téléchargez l'application Claude Desktop(s’ouvre dans un nouvel onglet)
- Dans l'application Claude Desktop, accédez à Paramètres > Extensions
- Cliquez sur « Parcourir les extensions »
- Cliquez sur « 10x Genomics »
- Cliquez sur « Installer »
- Suivez les instructions pour vous authentifier avec votre compte 10x Cloud Analysis
Découvrez comment installer des extensions de bureau depuis le répertoire(s’ouvre dans un nouvel onglet).
Cas d'usage courants
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Configurer une analyse de comptage Cell Ranger
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Configurer une analyse multi Cell Ranger avec multiplexage
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Traiter par lots plusieurs échantillons
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Surveiller et télécharger les résultats d'analyse
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Interpréter les métriques de contrôle qualité et les résultats
Des exemples de requêtes et des bonnes pratiques en matière de requêtes sont disponibles dans la documentation du serveur MCP 10x Genomics(s’ouvre dans un nouvel onglet).