El MCP de ToolUniverse le da a Claude acceso a una biblioteca de más de 600 herramientas científicas verificadas para explorar grandes espacios de hipótesis, comparar hipótesis en competencia e iterar a través de ciclos de análisis rápidos a lentos. Este artículo explica cómo configurar y usar la integración de ToolUniverse con Claude.
La integración de ToolUniverse está disponible como una extensión de escritorio en la aplicación Claude Desktop App (descárgala aquí(se abre en una pestaña nueva)), y se basa en la capacidad de Claude para usar conectores locales a través de una extensión de escritorio(se abre en una pestaña nueva).
Acerca de la integración de ToolUniverse
ToolUniverse es un ecosistema para crear científicos de IA y agentes de IA para la ciencia que trabajan con investigadores para generar hipótesis, convertirlas en planes de investigación ejecutables, ejecutar herramientas científicas y actualizar continuamente los análisis. Apunta a la investigación a escala para reimaginar el descubrimiento científico: los científicos de IA exploran grandes espacios de hipótesis, comparan hipótesis en competencia e iteran a través de ciclos de análisis rápidos a lentos en lugar de producir resúmenes puntuales.
ToolUniverse estandariza el uso de herramientas. Permite que los científicos de IA descubran y ejecuten herramientas a través de funciones locales de Python y servicios remotos servidos mediante MCP. Este diseño hace que cada paso sea inspeccionable: los científicos de IA componen flujos de trabajo de extremo a extremo que conectan conjuntos de datos, modelos y canalizaciones de análisis, y registran las entradas y salidas antes de elegir la siguiente acción. En la colaboración humano-IA, ToolUniverse admite un ciclo continuo de generación de hipótesis, llamadas a herramientas de búsqueda de información, ejecución de objetivos de investigación y refinamiento de modelos internos a medida que llegan nuevos datos experimentales y se generan nuevas perspectivas.
Conjuntos de datos y servicios disponibles en esta integración
Descargo de responsabilidad de ToolUniverse: ToolUniverse proporciona acceso a bases de datos y servicios científicos de terceros. Todos los derechos de autor y derechos de propiedad intelectual de los datos, contenidos y servicios enumerados a continuación pertenecen a sus respectivas fuentes y propietarios originales. ToolUniverse actúa únicamente como una plataforma de integración y no asume ninguna responsabilidad por la precisión, integridad o disponibilidad continua de estos recursos externos.
ToolUniverse proporciona acceso a un ecosistema integral de recursos científicos:
Bases de datos biológicas y modelos fundacionales biológicos
- UniProt - Base de datos completa de conocimiento de proteínas
- Ensembl - Datos genómicos y anotaciones
- RCSB PDB - Base de datos de estructuras de proteínas
- ChEMBL - Base de datos de moléculas bioactivas y descubrimiento de fármacos
- Bases de datos de NCBI - GenBank, RefSeq, base de datos de SNP
- Gene Ontology - Anotaciones de procesos biológicos, función y ubicación
- ESM - Modelos de lenguaje de proteínas
- TranscriptFormer - Modelos fundacionales de célula única
Bases de datos químicas y farmacológicas
- PubChem - Estructuras químicas y actividades biológicas
- DrugBank - Base de datos de fármacos y dianas farmacológicas
- ChEMBL - Moléculas pequeñas bioactivas similares a fármacos
- Bases de datos de la FDA - Aprobación de fármacos, información de prescripción de fármacos, eventos adversos, indicaciones y contraindicaciones de fármacos, interacciones farmacológicas
- ClinicalTrials.gov - Información de ensayos clínicos
Literatura y bases de conocimiento
- PubMed - Base de datos de literatura biomédica
- Semantic Scholar - Análisis de literatura impulsado por IA
- Europe PMC - Literatura biomédica de acceso abierto
- OpenAlex - Base de datos integral de trabajos académicos
- Crossref - Registro de DOI y metadatos
- OpenTargets - Perspectivas para la selección sistemática de dianas farmacológicas
Datos genómicos y de salud
- GTEx - Expresión génica específica de tejido
- GWAS Catalog - Estudios de asociación de todo el genoma
- ClinVar - Variación genética y relaciones con enfermedades
- OMIM - Herencia mendeliana en el hombre en línea (Online Mendelian Inheritance in Man)
- TCGA - Datos de genómica del cáncer
Herramientas de investigación y APIs
- OpenTargets - Asociaciones diana-enfermedad
- STRING - Redes de interacción proteína-proteína
- KEGG - Información de vías y enfermedades
- Reactome - Base de datos de vías biológicas
- InterPro - Familias y dominios de proteínas
Modelos de IA, agentes de IA, modelos fundacionales y generativos, visualizaciones y flujos de trabajo científicos
- AlphaFold - Predicción de estructura de proteínas
- BLAST - Búsqueda de similitud de secuencias
- ADMET-AI - Modelos de predicción de propiedades farmacológicas
- ChemTools - Utilidades de informática química
- Herramientas de visualización - Visualización molecular y de datos
Quién debería usar la integración de ToolUniverse
Científicos investigadores y académicos
Acelera la generación de hipótesis, automatiza las revisiones de literatura, realiza análisis complejos multibase de datos y escala las capacidades de investigación hacia plataformas emergentes de colaboración experimental entre IA y humanos.
Empresas farmacéuticas y biotecnológicas
Optimiza las canalizaciones de desarrollo de fármacos, mejora la identificación de dianas, mejora el diseño y la optimización de compuestos, el cribado virtual de fármacos, y acelera la generación de informes y la evaluación, mitigación de riesgos y validación de dianas.
Organizaciones de atención médica
Impulsa iniciativas de medicina de precisión, apoya el diseño y la optimización de ensayos clínicos con la selección de pacientes, facilita la investigación farmacogenómica, mejora las estrategias de estratificación de pacientes y extrae biomarcadores pronósticos y predictivos a partir de conjuntos de datos de salud multimodales.
Científicos de datos, ingenieros de ML, ingenieros de plataforma e infraestructura
Acceso a herramientas específicas del dominio sin desarrollo personalizado, creación rápida de prototipos de agentes de IA para la ciencia e integración de datos científicos en flujos de trabajo de ML.
Agencias gubernamentales y reguladoras
Mejora la toma de decisiones regulatorias, mejora el análisis de eventos adversos, acelera los procesos de aprobación de fármacos y ofrece un monitoreo integral de seguridad.
Quién puede acceder a la integración de ToolUniverse
ToolUniverse es de código abierto bajo la Apache License 2.0, lo que permite el acceso gratuito a todas las funciones de ToolUniverse. El código fuente está disponible en GitHub(se abre en una pestaña nueva).
Puedes encontrar más detalles sobre cómo acceder a la integración en la documentación del servidor MCP de ToolUniverse(se abre en una pestaña nueva).
Configuración de la integración de ToolUniverse
La integración de ToolUniverse está disponible como una extensión de escritorio en la aplicación Claude Desktop App (descárgala aquí(se abre en una pestaña nueva)). Para los propietarios de organizaciones (Team y Enterprise), configurar la integración implica poner la extensión a disposición de tu organización. Para los usuarios individuales, configurar la integración implica instalar la extensión desde dentro de la aplicación Claude Desktop App.
Para propietarios de organizaciones (Team y Enterprise)
Si tu organización usa la lista de permitidos de extensiones de escritorio (Desktop Extension Allowlist) (es decir, restringe a qué extensiones de escritorio pueden acceder los usuarios)…
- Ve a Configuración de administrador > Conectores
- Haz clic en la pestaña "Desktop" en la parte superior
- Confirma que "Allowlist" esté activado
- Haz clic en el botón "Browse"
- En el campo de búsqueda, escribe "ToolUniverse"
- Haz clic en ToolUniverse
- Haz clic en "Add to your team"
- Indica a tu equipo que descargue la aplicación Claude Desktop App(se abre en una pestaña nueva) para acceder a la integración siguiendo las instrucciones a continuación para usuarios individuales de Claude
Si tu organización no usa la lista de permitidos de extensiones de escritorio (Desktop Extension Allowlist) (es decir, no restringe a qué extensiones de escritorio pueden acceder los usuarios)…
- Ve a Configuración de administrador > Conectores
- Haz clic en la pestaña "Desktop" en la parte superior
- Confirma que "Allowlist" esté desactivado
- Si la lista de permitidos está desactivada, todos los usuarios de tu organización ya podrán acceder al directorio de extensiones de escritorio siguiendo las instrucciones a continuación para usuarios individuales de Claude
Para usuarios individuales de Claude
- Descarga la aplicación Claude Desktop App(se abre en una pestaña nueva)
- En la aplicación Claude Desktop App, ve a Configuración > Extensiones
- Haz clic en "Browse extensions"
- Haz clic en "ToolUniverse"
- Haz clic en "Install"
Obtén más información sobre cómo instalar extensiones de escritorio desde el directorio(se abre en una pestaña nueva).
Para usuarios de Claude Code
Sigue la guía de ToolUniverse para Claude Code(se abre en una pestaña nueva).
Los detalles técnicos de la integración de ToolUniverse se pueden encontrar en la documentación del servidor MCP de ToolUniverse(se abre en una pestaña nueva).
Ejemplos de casos de uso
Descubrimiento de fármacos y desarrollo terapéutico
- Descubrimiento terapéutico y flujos de trabajo de diana a candidato
- Prompt de ejemplo:
Identifica dianas para la hipercolesterolemia, prioriza una usando evidencia de OpenTargets y la literatura, luego examina fármacos conocidos y análogos cercanos, y clasifica a los candidatos según la unión predicha y las compensaciones de ADMET. Proporciona evidencia intermedia y una lista final de candidatos.
- Flujo de trabajo: Los científicos de IA impulsados por ToolUniverse:
- Consultan asociaciones enfermedad-diana usando la API de OpenTargets
- Obtienen estructuras de proteínas de RCSB PDB
- Analizan interacciones moleculares con datos de compuestos de ChEMBL
- Predicen afinidades de unión usando modelos de ML integrados
- Generan hipótesis de investigación para el desarrollo terapéutico
Genética humana e investigación genómica
- De la genética humana al mecanismo (de variante a gen a vía)
- Prompt de ejemplo:
A partir de los resultados de GWAS para la diabetes tipo 2, mapea las variantes a genes candidatos, resume las anotaciones funcionales y la expresión tisular, y devuelve las vías enriquecidas con referencias de respaldo y enlaces a las fuentes primarias.
- Flujo de trabajo: Los científicos de IA impulsados por ToolUniverse:
- Buscan en el catálogo GWAS variantes genéticas asociadas a enfermedades
- Mapean SNPs a genes usando las bases de datos de Ensembl y NCBI
- Obtienen anotaciones funcionales de Gene Ontology
- Analizan la expresión específica de tejido usando datos de GTEx
- Identifican vías biológicas usando KEGG y Reactome
Síntesis de literatura y evidencia multimodal
- Prompt de ejemplo:
Busca en PubMed y Europe PMC métodos recientes de detección de efectos fuera de diana (off-target) de CRISPR, extrae las configuraciones experimentales clave y los modos de fallo reportados, y produce una tabla comparativa estructurada con citas.
- Flujo de trabajo: Los científicos de IA impulsados por ToolUniverse:
- Búsquedas de literatura en múltiples bases de datos (PubMed, Europe PMC, bioRxiv)
- Resumen automatizado de artículos y extracción de hallazgos clave
- Análisis de redes de citas usando Semantic Scholar
- Identificación de tendencias mediante análisis temporal
- Referencias cruzadas con datos de ensayos clínicos de ClinicalTrials.gov
Análisis químico y molecular
- Prompt de ejemplo:
Usando las herramientas OpenFDA y ADMET-AI de ToolUniverse, analiza las propiedades moleculares de los fármacos aprobados por la FDA para la hipertensión, predice sus perfiles de ADMET e identifica patrones potenciales de efectos secundarios.
- Flujo de trabajo: Los científicos de IA impulsados por ToolUniverse:
- Consultan las bases de datos de fármacos de la FDA para medicamentos aprobados
- Calculan descriptores y propiedades moleculares
- Predicen perfiles farmacocinéticos usando modelos de ADMET-AI
- Analizan relaciones estructura-actividad
- Identifican posibles oportunidades de reposicionamiento de fármacos
Descubrimiento científico y automatización para estudios con múltiples herramientas
- Prompt de ejemplo:
Crea un flujo de trabajo reutilizable que ejecute múltiples búsquedas de literatura en paralelo, consolide los resultados y produzca un informe reproducible. Devuelve el flujo de trabajo como una herramienta compuesta con entradas y salidas claras. Usando las herramientas de UniProt, PRIDE y vías de KEGG de ToolUniverse, diseña un flujo de trabajo de proteómica completo: desde la identificación de proteínas usando datos de espectrometría de masas hasta el análisis funcional y el mapeo de vías.
- Flujo de trabajo: Los científicos de IA impulsados por ToolUniverse:
- Integran bases de datos proteómicas multimodales (UniProt, PRIDE)
- Automatizan el procesamiento de datos y el control de calidad de las lecturas proteómicas
- Anotan funciones de proteínas y realizan análisis de vías
- Completan análisis estadísticos y generan visualizaciones interactivas
- Generan informes con resúmenes
Demostraciones y documentación
Demostraciones en vivo
- Plataforma web interactiva: AIScientist.Tools(se abre en una pestaña nueva) - Interfaz en vivo de descubrimiento y ejecución de herramientas para explorar más de 700 herramientas científicas
- Demostraciones en video: Disponibles en YouTube(se abre en una pestaña nueva)
- Repositorio de GitHub: ToolUniverse en GitHub(se abre en una pestaña nueva) - Código fuente completo, documentación y comunidad con más de 797 estrellas
Documentación y tutoriales
La documentación está disponible en ToolUniverse Documentation(se abre en una pestaña nueva) y cubre la instalación, el uso y las funciones avanzadas, incluido un tutorial de inicio rápido para una configuración de 5 minutos y experimentación inmediata con herramientas científicas, y guías de integración con modelos de lenguaje grandes, agentes de IA y modelos de razonamiento.
Recursos comunitarios
Accede a los recursos comunitarios a través de nuestra comunidad de Slack(se abre en una pestaña nueva) para apoyo entre pares y colaboración, y GitHub Issues(se abre en una pestaña nueva) para reportar errores y solicitar funciones.