Verwendung der 10x Genomics-Erweiterung in Claude

Die 10x Genomics-Integration verwandelt Einzelzell- und räumliche Analysen in einen einfachen, konversationellen Workflow. Biologen können ihre eigenen Sequenzierungsdaten problemlos analysieren, während Core-Labs schnell Batch-Verarbeitungen durchführen können. Dieser Artikel erklärt, wie du die 10x Genomics-Integration mit Claude einrichtest und nutzt, um deine Analyse-Workflows voranzubringen.

Die 10x Genomics-Integration ist als Desktop-Erweiterung in der Claude Desktop App verfügbar (hier herunterladen) und beruht auf Claudes Fähigkeit, lokale Konnektoren über eine Desktop-Erweiterung zu nutzen.

Was diese Integration bietet

Die 10x Genomics-Integration ermöglicht es Forschern, Workflows für die Einzelzell-Genomanalyse im Gespräch mit Claude zu erstellen und zu verwalten. Nutzer können Daten hochladen, Cell-Ranger-Pipelines konfigurieren und starten, den Analysestatus überwachen und Ergebnisse mithilfe natürlicher Sprachaufforderungen herunterladen, anstatt Kommandozeilen-Tools oder Weboberflächen zu verwenden. Die Integration übersetzt konversationelle Anfragen in Aktionen auf der 10x Cloud Analysis-Plattform und optimiert so Workflows für Genexpressions-, Zell-Multiplexing- und CRISPR-Screening-Analysen.

Wer die 10x Genomics-Integration nutzen sollte

• Computational Biologists: Forscher, die Einzelzell-Genomikdaten analysieren und cloudbasierte Analyse-Workflows optimieren möchten

• Bioinformatiker: Wissenschaftler, die mehrere Proben verarbeiten und effiziente Batch-Verarbeitungsfähigkeiten benötigen

• Forschungswissenschaftler: Laborforscher, die Einzelzelldaten generieren und eine intuitive Oberfläche zum Ausführen von Standard-Pipelines wünschen

• Core-Facility-Manager: Mitarbeiter, die Proben für mehrere Forschungsgruppen verarbeiten und zahlreiche Analysen verwalten müssen

Wer Zugriff auf die 10x Genomics-Integration hat

Jeder Nutzer mit einem 10x Cloud Analysis-Konto (hier ein kostenloses Konto erstellen)

Weitere Details zum Zugriff auf die Integration findest du in der 10x Genomics MCP-Server-Dokumentation.

Einrichten der 10x Genomics-Integration

Die 10x Genomics-Integration ist als Desktop-Erweiterung in der Claude Desktop App verfügbar (hier herunterladen). Für Organisationsinhaber (Team und Enterprise) umfasst die Einrichtung der Integration, die Erweiterung für deine Organisation verfügbar zu machen. Für einzelne Nutzer umfasst die Einrichtung der Integration die Installation der Erweiterung innerhalb der Claude Desktop App.

Für Organisationsinhaber (Team und Enterprise)

Wenn deine Organisation die Desktop-Erweiterungs-Zulassungsliste verwendet (d. h. einschränkt, auf welche Desktop-Erweiterungen Nutzer zugreifen können)…

1. Navigiere zu Admin-Einstellungen > Konnektoren
2. Klicke oben auf den Tab „Desktop“
3. Bestätige, dass „Zulassungsliste“ aktiviert ist
4. Klicke auf die Schaltfläche „Durchsuchen“
5. Gib im Suchfeld „10x Genomics“ ein
6. Klicke auf 10x Genomics
7. Klicke auf „Zum Team hinzufügen“
8. Weise dein Team an, die Claude Desktop App herunterzuladen, um anhand der untenstehenden Anweisungen für einzelne Claude-Nutzer auf die Integration zuzugreifen

Wenn deine Organisation die Desktop-Erweiterungs-Zulassungsliste nicht verwendet (d. h. nicht einschränkt, auf welche Desktop-Erweiterungen Nutzer zugreifen können)…

1. Navigiere zu Admin-Einstellungen > Konnektoren
2. Klicke oben auf den Tab „Desktop“
3. Bestätige, dass „Zulassungsliste“ deaktiviert ist
4. Wenn die Zulassungsliste deaktiviert ist, können alle Nutzer in deiner Organisation bereits anhand der untenstehenden Anweisungen für einzelne Claude-Nutzer auf das Desktop-Erweiterungsverzeichnis zugreifen

Für einzelne Claude-Nutzer

1. Lade die Claude Desktop App herunter
2. Navigiere in der Claude Desktop App zu Einstellungen > Erweiterungen
3. Klicke auf „Erweiterungen durchsuchen“
4. Klicke auf „10x Genomics“
5. Klicke auf „Installieren“
6. Folge den Anweisungen, um dich mit deinem 10x Cloud Analysis-Konto zu authentifizieren

Erfahre mehr über die Installation von Desktop-Erweiterungen aus dem Verzeichnis.

Häufige Anwendungsfälle

• Eine Cell-Ranger-Count-Analyse einrichten

• Eine Cell-Ranger-Multi-Analyse mit Multiplexing einrichten

• Mehrere Proben im Batch verarbeiten

• Analyseergebnisse überwachen und herunterladen

• QC-Metriken und Ergebnisse interpretieren

Beispiel-Prompts und Best Practices für das Prompting findest du in der 10x Genomics MCP-Server-Dokumentation.

Weitere Ressourcen von 10x Genomics

• 10x Cloud Analysis-Support

• Cell Ranger-Dokumentation

• 10x Genomics MCP-Server-Dokumentation