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So verwendest du das scVI-Tools-Bioinformatik-Skill-Bundle mit Claude

So verwendest du das scVI-Tools-Bioinformatik-Skill-Bundle mit Claude

3 Min.Claude

Was ist das scVI-Tools-Skill-Bundle?

Ein einzelner Skill, der umfassenden Zugriff auf Deep-Learning-basierte Einzelzellanalyse mithilfe von scvi-tools und dem scVerse-Ökosystem bietet und Batch-Integration (scVI, scArches), Zelltyp-Annotation (SCANVI, CellAssign), Dekonvolution räumlicher Transkriptomik (DestVI, Tangram, cell2location, Stereoscope), Analyse der Chromatin-Zugänglichkeit (PeakVI, scBasset), Integration multimodaler Daten (TotalVI für CITE-seq, MultiVI für RNA+ATAC) und Perturbationsanalyse (contrastiveVI) abdeckt. Jeder Skill bietet schrittweise Workflows, Anleitungen zur Parameterabstimmung und Fehlerbehebung für das jeweilige scvi-tools-Modell.

Wer sollte das scVI-Tools-Skill-Bundle verwenden?

Dieser Skill ist für Wissenschaftler konzipiert, die Einzelzelldaten analysieren – einschließlich räumlicher, epigenetischer und scRNA-Daten – und die Deep-Learning-Methoden von scvi-tools nutzen möchten, ohne umfangreiche Dokumentation lesen zu müssen. Besonders nützlich ist er für Forscher, die mit Multi-Batch-Experimenten, multimodalen Assays (CITE-seq, Multiome), räumlicher Transkriptomik oder scATAC-seq arbeiten und Anleitung zur Modellauswahl, Parameterabstimmung und Best Practices benötigen.

Wie du auf die Skills in Claude Code zugreifst

  1. Lade die ZIP-Datei für den scvi-tools-Skill herunter
  2. Entpacke sie auf deinem eigenen Computer in einen neuen Ordner namens scvi-tools innerhalb von ~/.claude/skills/, sodass sich die SKILL.md-Datei des Skills unter ~/.claude/skills/scvi-tools/SKILL.md befindet
  3. Starte Claude Code und führe /skills aus, um zu überprüfen, dass scvi-tools aufgelistet ist

Erfahre mehr darüber, von wo aus Claude Code Skills lädt.

Wie du auf den Skill in Claude.ai zugreifst

Für Organisationsinhaber (Team und Enterprise)

  1. Lade die ZIP-Datei für den scvi-tools-Skill hier herunter
  2. Navigiere von Claude.ai aus zu Admin-Einstellungen > Capabilities > Skills
  3. Stelle sicher, dass Skills für deine Organisation aktiviert ist
  4. Klicke auf „Organisations-Skill-Bibliothek“
  5. Klicke auf „+Hinzufügen“
  6. Lade die Skill-ZIP-Datei hoch

Erfahre mehr über die Bereitstellung und Verwaltung von Skills für deine Organisation

Für einzelne Claude-Nutzer

  1. Lade die ZIP-Datei für den scvi-tools-Skill hier herunter
  2. Navigiere von Claude.ai aus zu Einstellungen > Capabilities > Skills (falls Skills nicht verfügbar ist, wende dich an deinen Team-Administrator)
  3. Klicke auf „Skill hochladen“
  4. Lade die Skill-ZIP-Datei hoch